No inventes la rueda, te vas a volver loco. Fijate en Documentation/kbuild/makefiles.txt que explica como trabajar con los make file del kernel. Podrías probar editando el archivo 8139too.c y sacar los #ifdef CONFIG_* si ese CONFIG esta actviado, o comentando todo lo que esta entre el #ifdef y el #endif si lo queres desactivar.